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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

检察机关依法分别对张文富、陈鹏飞、陈志刚决定逮捕******

　　中新网1月19日电 据最高检官方微信消息，日前，检察机关依法分别对张文富、陈鹏飞、陈志刚决定逮捕。

　　贵州检察机关依法对张文富决定逮捕

　　贵州省人民政府办公厅原党组成员、机关党委原书记张文富(正厅级)涉嫌受贿、利用影响力受贿一案，由贵州省监察委员会调查终结，移送检察机关审查起诉。经贵州省人民检察院指定管辖，由毕节市人民检察院审查起诉。日前，毕节市人民检察院依法以涉嫌受贿罪、利用影响力受贿罪对张文富作出逮捕决定。该案正在进一步办理中。

　　山西检察机关依法对陈鹏飞决定逮捕

　　山西省长治市原副市长陈鹏飞(副厅级)涉嫌受贿一案，由山西省监察委员会调查终结，移送检察机关审查起诉。经山西省人民检察院交办，由运城市人民检察院审查起诉。日前，运城市人民检察院依法以涉嫌受贿罪对陈鹏飞作出逮捕决定。案件正在进一步办理中。

　　辽宁检察机关依法对陈志刚决定逮捕

　　辽宁省鞍山市原副市长、市公安局原局长陈志刚(副厅级)涉嫌贪污、受贿一案，由辽宁省监察委员会调查终结，移送检察机关审查起诉。经辽宁省人民检察院指定管辖，由沈阳市人民检察院审查起诉。日前，沈阳市人民检察院依法以涉嫌贪污罪、受贿罪对陈志刚作出逮捕决定。该案正在进一步办理中。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）