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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

催熟西红柿能吃吗？关于西红柿的安全问题你需要知道这些******

　　西红柿酸甜可口，营养丰富，是餐桌上颇受欢迎的一道食材。不过，西红柿也被各种流言缠身，网络有传言称“催熟的西红柿不能吃”“泛青西红柿有毒不能吃”，一起看看这些关于西红柿的谣言。

　　被催熟的西红柿食用安全吗？

　　谣言：随着技术发展，有些种植者在种植西红柿的售后会使用催熟剂，网络有说法认为，催熟的西红柿会影响身体健康。

　　真相：江西省市场监管局发布文章称，人工催熟技术在果蔬农业领域广泛使用，尤其是香蕉、芒果等热带水果。人工催熟的目的是加速果蔬生长和成熟，果蔬待充分成熟再采摘不利于长期保存和远途运输。乙烯利是最常使用的催熟剂，是一种人工合成的低毒植物生长调节剂，种植者只要按照食品安全国家标准规定使用，生产符合食品安全国家标准的西红柿是可以放心食用的。另外，乙烯利易溶于水，消费者购买西红柿后食用前用清水浸泡冲洗就可以去除表面残留的乙烯利。

　　未成熟的泛青西红柿能吃吗？

　　谣言：网络有流传，未成熟的泛青西红柿含有毒素不能吃。

　　真相：江西省市场监管局发布的科普文章称，未成熟的西红柿中含有一定的龙葵碱，龙葵碱是一种有毒的生物碱，摄入体内后会对肠道产生强烈的刺激性，还会对动物的神经中枢产生麻痹作用，所以，未成熟的泛青的西红柿不建议食用，食用时最好选择成熟西红柿。

　　尖头西红柿是激素使用过量影响健康？

　　谣言：有消费者认为，尖头西红柿是激素使用过量，长期食用会中毒。

　　真相：甘肃省农科院蔬菜研究所番茄研究室副研究员胡志峰在腾讯较真平台发文称，尖头西红柿可能是品种不同或是生长过程中出现畸形，目前没有研究证明食用尖头西红柿对人体健康不利。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）